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Category软件学习

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  • 分类归档: "软件学习"
5月 31, 2020

动物转录因子数据库

作者 smyang2018 在生物信息学, 软件学习

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB/#!/

5月 2, 2020

历史目录

作者 smyang2018 在ggplot2, Linux, Perl, pheatmap, Python, R, 可视化, 小工具, 归档, 生活, 生物信息学, 脚本, 软件学习

微信公众号历史目录更新。 1 、按行名进行表格筛选:python&R 2、服务器 | 环境变量配置 3

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4月 25, 2020

R包pheatmap:用参数一步步详细绘制热图

作者 smyang2018 在pheatmap, R, 可视化, 归档, 生物信息学, 脚本, 软件学习

经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用R中pheatmap包一步步绘制热图。 第一步:公

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4月 24, 2020

iTOL绘制进化树

作者 smyang2018 在可视化, 归档, 生物信息学, 软件学习

通常呢我们应用clustalw进行比对,比对之后呢,利用MEGA(话说现在MGEA X(https://www

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3月 20, 2020

转录因子数据库PlantTFDB使用及预测TF,Cytoscape可视化结果

作者 smyang2018 在可视化, 归档, 生物信息学, 软件学习

本节主要讲解转录因子数据库PlantTFDB的使用,预测转录因子等。 介绍PlantTFDB: 该数据库可以直

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9月 2, 2019

NCBI数据下载

作者 smyang2018 在Linux, 归档, 生物信息学, 脚本, 软件学习

最近看大家都说NCBI的数据不好下载,我也是觉着是,反正就是坑,既然是坑,明知道,但是,往下跳吧…

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8月 7, 2019

R安装及使用

作者 smyang2018 在R, 可视化, 归档, 生物信息学, 脚本, 软件学习

安装 表示很简单一直下一步, Win+R>cmdperl -v 表示安装成功,同时建议最好安装Rstud

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4月 10, 2019

BLAST比对得到目标序列

作者 smyang2018 在Linux, 归档, 生物信息学, 脚本, 软件学习

这里我们不用服务器,同样我们利用的是Git软件,同样可以进行blast比对 此处以拟南芥为例: 在拟南芥基因组

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4月 8, 2019

你在用xshell,putty登陆?推荐一个小工具(Git)登陆

作者 smyang2018 在Linux, 归档, 脚本, 软件学习

请关注微信公众号 去历史记录查找,谢谢!

3月 26, 2019

awk

作者 smyang2018 在Linux, 可视化, 归档, 生物信息学, 脚本, 软件学习

awk ‘NR==FNR{a[$1]}NR!=FNR{if ($1 in a) print $0}

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