确定目标基因

确定目标基因

通常我们都是看文章然后得到我们需要的目标序列,但是我们想要到目标物种里面去看,目标物种里面有这个基因吗,此时我们需要去我们需要查看物种对应的基因组里面查找。

1、确定序列,读文章得到序列对应的ID,我们可以去NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),Uniprot(https://www.uniprot.org/)等对应数据库查到这条序列。

2、确定这条是否为我们需要的序列

hmmer(https://www.ebi.ac.uk/Tools/hmmer/)将对应的序列放进去,即可(注:需要输入蛋白序列)。

3、下载对应的模型

欢迎关注微信公众号:蚂蚁生信

如若有问题,或侵犯您的版权请及时联系我,谢谢:smyang2018@gmail. com

smyang2018

目前为止有一条评论

如何鉴定一个基因的基因家族 – 东翎赋 发布于1:21 下午 - 3月 15, 2019

[…] 如何知道这个基因是我们需要的目标基因? 2019年2月24日 […]

跳至工具栏