常见的植物数据库(更新-Ing)

常见的植物数据库(更新-Ing)

1、NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

2、Uniprot:https://www.uniprot.org/

3、KEGG:https://www.kegg.jp/

4、InterPro:https://www.ebi.ac.uk/interpro/

5、DDBJ:https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html

6、
Phytozome :https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html#

7、http://plants.ensembl.org/index.html

8、https://solgenomics.net/

9、http://genomes.cribi.unipd.it/grape/

10、http://www.plantgdb.org/MtGDB/

11、http://solanaceae.plantbiology.msu.edu/pgsc_download.shtml

12、http://rice.plantbiology.msu.edu/

13、https://www.arabidopsis.org/index.jsp

14、http://www.medicagohapmap.org/home/view

15、ftp://ftp.kazusa.or.jp/pub/eggplant/

16、http://www.kazusa.or.jp/lotus/

17、http://www.plantkingdomgdb.com/tea_tree/

18、http://www.kazusa.or.jp/genome/

19、https://www.ebi.ac.uk/interpro/

20、http://plantregmap.cbi.pku.edu.cn/index.php

21、http://ted.bti.cornell.edu/

22、https://www.rosaceae.org/

23、http://peargenome.njau.edu.cn/

TAIR:https://www.arabidopsis.org/


RICE:http://rice.plantbiology.msu.edu/


Sol genomic Network:https://solgenomics.net/


TGRC(Tomato Genetic Resoure Center):https://tgrc.ucdavis.edu/


Grape 12X:http://www.genoscope.cns.fr/externe/GenomeBrowser/Vitis/


Grape Genome:http://genomes.cribi.unipd.it/grape/index.php


Maize:https://www.maizegdb.org/


Citrus sinensis:http://citrus.hzau.edu.cn/orange/index.php


Ensemblplants:http://plants.ensembl.org/index.html


Phytozome12:https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html


Plant Genome Duplication Database:http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/index/locus


NCBI db:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db


NCBI genomes:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/

软件及资料分享学习(以后更新的都会放进来的)https://pan.baidu.com/s/1CyQzCp2NqR6eXdPwTFPd1w ;提取码:2c1h

如果说链接失效了,请联系本人

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如若有问题,或侵犯您的版权请及时联系我,谢谢:smyang2018@gmail.com

smyang2018

目前为止有一条评论

如何鉴定一个基因的基因家族 – 东翎赋 发布于1:28 下午 - 3月 15, 2019

[…] 1、利用软件HMMER进行模型搜索,主要用到hmmsearch,已经来自pfam数据库的隐马尔可夫模型。(所用到的数据都上传到网盘了,查看:http://132.232.42.33/?p=59) […]

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